Lögaðili stofnar aðgang að kerfi Tilkynna sem býr til sérstaka vefslóð fyrir tilkynnendur. Þar geta starfsmenn sem vilja tilkynna misferli fyllt inn upplýsingar varðandi málið. Starfsmaður getur sent tilkynninguna með nafnleynd og átt frekari samskipti í gegnum nafnlausa gátt.
Fyllsta öryggis og trúnaðar er gætt við meðferð og meðhöndlun tilkynninga. Farið er með allar upplýsingar í samræmi við grundvallarsjónarmið og reglur um persónuvernd.
Lögaðili getur stofnað mörg mismunandi tilkynningasvæði. Það getur hentað stærri fyrirtækjum eða stofnunum til að aðgreina í sundur mismunandi hópa eins og deildir eða verktaka. Hvert tilkynningarsvæði fær sitt eigið undirlén, t.d. verktakar-fyrirtaeki.tilkynna.is og starfsmenn-fyrirtaeki.tilkynna.is.
Við umsýslu tilkynninga er hægt að breyta málsheiti, setja stöðu málsins, bæta við umsjónaraðilum og skrá merkimiða. Þar er líka hægt að skrifa athugasemdir, til dæmis ef teymi innan lögaðila vill gefa álit á málinu. Einnig er hægt að eiga samskipti við tilkynnanda ef óskað er eftir frekari upplýsingum.
Umsjónaraðili getur boðið utanaðkomandi aðila inn á tilkynningu til þess að skrifa umsögn. Þetta eykur bæði öryggi og gagnsæi þar sem lögaðili þarf ekki að senda viðkvæmar upplýsingar tilkynnanda í gegnum tölvupóst eða önnur kerfi. Öll gögn og samskipti um málið eiga heima á einum stað hjá Tilkynna.
Einnig er möguleiki á að:
Nafnlaus gátt er stofnuð fyrir allar tilkynningar og er gáttin varin með sérstöku auðkennisnúmeri og lykilorði. Þar getur lögaðili óskað eftir frekari upplýsingum frá tilkynnanda um málið og tilkynnandi getur fylgst með framvindu málsins.
Tilkynnendur geta auðkennt sig með rafrænum skilríkjum í gegnum Ísland.is ef lögaðili óskar eftir því.
Móttakandi tilkynninga eða gagna skal gæta leyndar um persónuupplýsingar tilkynnanda nema viðkomandi veiti afdráttarlaust samþykki sitt.
Umsýslukerfi Tilkynna birtir aldrei persónuupplýsingar tilkynnanda, nema þegar lögaðili óskar eftir þeim. Þegar lögaðili óskar eftir persónuupplýsingum tilkynnanda þá þarf hann að gefa ástæðu fyrir því sem verður skráð í atburðaskrá.
Yfirlitssíðan gefur lögaðila innsýn í núverandi stöðu og heildartölur fyrir árið, ásamt línuritum sem sýna mótteknar og lokaðar tilkynningar, fjöldi skipta sem merkimiðar eru notaðir, fjölda skipta sem umsjónaraðilar eru skráðir á tilkynningar og hvernig tilkynningar eru afgreiddar.
Umsýslukerfi Tilkynna skráir allar aðgerðir inn í atburðaskrá sem ekki er hægt að eiga við. Þar getur lögaðili séð allar aðgerðir sem hafa verið framkvæmdar.